Bộ Tư pháp Mỹ muốn đọc toàn bộ thông tin này, song hệ thống mã hóa của Apple đã khiến iMessage trở nên "bất khả xâm phạm". Apple nhấn mạnh rằng họ không thể làm gì khác để hỗ trợ cơ quan an ninh, bất chấp những đe dọa về pháp lý.

Hệ thống mã hóa đầu cuối "end-to-end" của Apple được giới thiệu nhằm tăng cường khả năng riêng tư cho người dùng và được đánh giá là một trong những dịch vụ bảo mật hàng đầu. Từng xuất hiện thông tin chính phủ, tình báo hay các cơ quan an ninh có thể xâm nhập vào iMessage, tuy nhiên Apple đã lên tiếng phủ nhận điều này.

Công ty công nghệ Mỹ đưa ra giải tích chi tiết cách thức mã hóa dịch vụ nhắn tin của họ. Chỉ có người dùng sở hữu chìa khóa riêng tư (Private Key) mới có thể giải mã, đồng thời Apple tái khẳng định ngay cả hãng và bất kỳ ai cũng không thể tùy ý đọc thông tin trao đổi qua iMessage.

iMessage bảo mật cũng làm nổ ra cuộc tranh luận rằng việc mã hóa như thế sẽ gây khó khăn trong quá trình điều tra và bắt giữ tội phạm. Gần đây, Nhà nước Hồi giáo đã khuyến cáo thành viên của mình dùng iMessage thay cho những chương trình nhắn tin khác.